SNP, gene | Genotype | Serum 25(OH) D ≤20 nmol/l | Serum 25(OH) D >20 nmol/l | ||||||||
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TB cases | Controls | OR(95 % CI) | P | TB cases | Control | OR(95 % CI) | P | Adjusted ratio of odds ratiosa | P interaction | ||
rs7312236, VDR | AA | 30/102(29 %) | 12/24(50 %) | Ref | - | 54/128(42 %) | 30/76(40 %) | Ref | - | Ref | - |
AG/GG | 72/102(71 %) | 12/24(50 %) | 2.40(0.96-5.94) | 0.054 | 74/128(58 %) | 46/76(60 %) | 0.89(0.50-1.59) | 0.70 | 1.65(0.59-4.58) | 0.33 | |
rs154410, VDR | CC | 16/105(15 %) | 8/25(32 %) | Ref | - | 37/130(29 %) | 21/81(26 %) | Ref | Ref | - | |
CT/TT | 89/105(85 %) | 17/25(68 %) | 2.61(0.96-7.07) | 0.052 | 93/130(71 %) | 60/81(74 %) | 0.88(0.47-1.64) | 0.68 | 2.16(0.69-6.75) | 0.18 | |
rs228570, VDR | GG | 60/105(57 %) | 13/25(52 %) | Ref | - | 77/130(59 %) | 55/82(67 %) | Ref | Ref | - | |
GA/AA | 45/105(43 %) | 12/25(48 %) | 0.81(0.33-1.94) | 0.64 | 53/130(41 %) | 27/82(33 %) | 1.40(0.78-2.5) | 0.25 | 0.48(0.17-1.29) | 0.14 | |
rs10500804, CYP2R1 | GG | 27/102(26 %) | 6/23(26 %) | Ref | - | 32/129(25 %) | 16/80(20 %) | Ref | Ref | - | |
GT/TT | 75/102(74 %) | 17/23(74 %) | 0.98(0.35-2.74) | 0.97 | 97/129(75 %) | 64/80(80 %) | 0.75(0.38-1.49) | 0.42 | 1.51(0.47-4.8) | 0.48 | |
rs2060793, CYP2R1 | GG | 48/104(46 %) | 11/22(50 %) | Ref | - | 64/124(52 %) | 40/79(51 %) | Ref | Ref | - | |
AG/AA | 56/104(54 %) | 11/22(50 %) | 1.16(0.46-2.92) | 0.74 | 60/124(48 %) | 39/79(49 %) | 0.96(0.54-1.69) | 0.89 | 1.02(0.37-2.78) | 0.96 | |
rs10766197, CYP2R1 | AA | 23/104(22 %) | 4/23(17 %) | Ref | - | 29/128(23 %) | 15/81(19 %) | Ref | Ref | - | |
AG/GG | 81/104(78 %) | 19/23(83 %) | 0.74(0.22-2.39) | 0.60 | 99/128(77 %) | 66/81(81 %) | 0.77(0.38-1.55) | 0.47 | 1.25(0.35-4.45) | 0.72 | |
rs7041, DBP | AA | 27/104(52 %) | 4/23(43.5 %) | Ref | - | 26/133(20 %) | 19/74(47 %) | Ref | Ref | - | |
AC/CC | 77/10(35 %) | 19/23(43.5 %) | 0.60(0.18-1.9) | 0.39 | 107/133(80 %) | 55/74(45 %) | 1.42(0.72-2.79) | 0.30 | 1.15(0.34-3.88) | 0.81 | |
rs4588, DBP | GG | 55/105(52 %) | 10/24(42 %) | Ref | - | 68/135(50 %) | 38/76(50 %) | Ref | - | Ref | - |
GT/TT | 50/105(48 %) | 14/24(58 %) | 0.64(0.26-1.59) | 0.34 | 67/135(50 %) | 38/76(50 %) | 0.98(0.56-1.72) | 0.95 | 0.93(0.35-2.48) | 0.89 |